Im Labor für Prozesskontrolle und Strukturaufklärung werden komplexe Produktgemische aus organischen Synthesen oder Naturstoffextraktionen auf Ihre Komponenten hin analysiert. Dazu verfügt das Labor über verschiedene instrumentelle Anlagen für die Gaschromatographie, die Hochleistungsflüssigkeitschromatographie und die Massenspektrometrie.

Es stehen GC‐FID, GC‐MS und GC‐MS/MS Methoden für verdampfbare Proben, sowie
HPLC‐DAD und HPLC‐MS Methoden für nicht flüchtige und hochpolare Proben zur
Verfügung.

Komplementiert werden die analytischen Methoden durch präparative chromatographische Trennverfahren, wie der präparativen HPLC und der automatisierten Flashchromatographie auf normalen sowie Umkehrphasen, um die komplexen Substanzgemische in ihre einzelnen Komponenten aufzutrennen. Die isolierten Reinstoffe können dann mittels der FTIR‐, der NMR‐Spektroskopie und der
Massenspektrometrie charakterisiert werden.